魔法科高中的劣等生:呼喚繁星的少女

故事的起点是2095年，魔法不再隐晦而虚无缥缈，早就被广泛运用在科学技术层面，魔法变成人人都想学习的能力，所以各国都有多所学校致力培养魔法师。其中司波达也与司波深雪这对兄妹一同进入“国立魔法大学附属第一高中”，哥哥达也被认为是劣等生，而妹妹深雪则是耀眼的优等生，但兄妹俩毫不在意这样的说法，因为哥哥明白自己是强者，而妹妹对兄长则抱有仰慕的敬意，伴随着两人的入学，平稳的日常生活开始变得波澜万丈，两人的关系也悄悄改变…… 时日迁移，魔法科高中的第二个春天悄悄来临。达也与深雪利用春假，来到了小笠原诸岛的别墅度假，悠闲惬意之际，两人却遇到了从海军基地脱逃的少女“九亚”，少女将愿望托付给最强的劣等生达也，希望达他能帮助她解救困在基地里的同胞。少女的身分是什么呢？又为何逃跑？伴随着一幕又一幕惊心动魄的战斗画面，幕后指使的的身影隐隐绰绰浮上台面，司波达也要如何以他王牌战略级魔法师的身分保护妹妹深雪及九亚等人？